Выбрать язык / Select language:
Ukranian
English
French
German
Japanese
Italian
Portuguese
Spanish
Danish
Chinese
Korean
Arabic
Czech
Estonian
Belarusian
Latvian
Greek
Finnish
Serbian
Bulgarian
Turkish
body { background-color: #E5E5E5; scrollbar-face-color: #DEE3E7; scrollbar-highlight-color: #FFFFFF; scrollbar-shadow-color: #DEE3E7; scrollbar-3dlight-color: #D1D7DC; scrollbar-arrow-color: #006699; scrollbar-track-color: #EFEFEF; scrollbar-darkshadow-color: #98AAB1;}
Воскресенье, 29.05.2022, 12:17Главная | Регистрация | Вход

Меню сайта

Форма входа

Приветствую Вас Гость!

Друзья сайта

Мини-чат

Наш опрос

Оцените мой сайт
Всего ответов: 337

Статистика

Гуппи и кроссинговер - Форум / ForumГуппи и кроссинговер - Форум / Forum
[ Новые сообщения · Участники · Правила форума · Поиск · RSS ]
  • Страница 1 из 6
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • »
Форум / Forum » Гуппи (Poecilia reticulata Peters 1859) » Генетика гуппи » Гуппи и кроссинговер
Гуппи и кроссинговер
genetika-guppyДата: Вторник, 01.09.2009, 09:53 | Сообщение # 1
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Иногда в абсолютно чистых гомозиготных линиях мы получаем рыб с отличным от остальных особей фенотипом.

Основная причина этого феномена - кроссинговер.

Кроссинговер — явление, при котором гомологичные хромосомы обмениваются своими участками.

Ученые уже много десятилетий с помощью кроссинговерап составляют генетические карты животных.

Гуппи не является исключением.

В этой теме я предлагаю собирать материалы по кроссинговеру у гуппи.

В статье д-ра Трипати с соавт. собран уникальный материал и построена генетическая карта гуппи:

http://genetika-guppy.my1.ru/load/13-1-0-16

Эта карта показывает размер всех хромосом гуппи, а также расположение полоопределяющего участка (хромосома 12) и некоторых генов окраса.

В статье было исследовано потомство (около 2000 рыб) от нескольких крестов двух лабораторных линий диких гуппи.

В результате средняя частота кроссинговера была следующая:

- отсутсвие кроссинговера - 44%

- одиночный кросссинговер - 44%,

- двойной кроссинговер - 10%

- тройной и другие варианты кроссинговера - 0,43%

Таким образом, % кроссоверных особей показывает % отклонения от фенотипа в потомстве (в данном случае разных лабораторных линий диких гуппи).

 
genetika-guppyДата: Суббота, 23.01.2010, 22:54 | Сообщение # 2
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Интересный вывод. Посмотрите какой большой процент кроссоверных особей в целом (по всем генам) и какой он низкий - реально на практике. Именно этот механизм помогает гуппи бороться с инбридингом и другими генетическимии популяционными проблемами.
 
OzДата: Понедельник, 25.01.2010, 22:42 | Сообщение # 3
Полковник
Группа: Пользователи
Сообщений: 250
Награды: 0
Репутация: 2
Статус: Offline
А почему ты решил, что на практике процент кроссоверных особей меньше? На практике мы наблюдаем очень малое, по сравнению со всеми генами, число признаков. Они в основном влияют на внешность гуппи - окраска, форма тела и плавников, размеры и пожалуй всё. Всего остального мы просто не видим.
 
genetika-guppyДата: Понедельник, 25.01.2010, 22:51 | Сообщение # 4
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Quote (Oz)
А почему ты решил, что на практике процент кроссоверных особей меньше? На практике мы наблюдаем очень малое, по сравнению со всеми генами, число признаков. Они в основном влияют на внешность гуппи - окраска, форма тела и плавников, размеры и пожалуй всё. Всего остального мы просто не видим.

Не стоит забывать, что породистые гуппи намного более огомозигоченые и не только по тем генам, которые мы "видим". % кроссинговера конечно такой же, но эффект от него намного меньше - кол-во гомозигот выше и большинство обменов гомологичными участками никакого генетического разнообразия не несут.
Вот это я и имел ввиду. wink

 
genetika-guppyДата: Понедельник, 25.01.2010, 23:12 | Сообщение # 5
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Quote (genetika-guppy)
% кроссинговера конечно такой же, но эффект от него намного меньше - кол-во гомозигот выше и большинство обменов гомологичными участками никакого генетического разнообразия не несут.

biggrin

 
genetika-guppyДата: Понедельник, 25.01.2010, 23:45 | Сообщение # 6
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Quote (Владимир)
хороший подсчет процентов

ну как то так tongue

 
genetika-guppyДата: Вторник, 26.01.2010, 09:36 | Сообщение # 7
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Quote (Владимир)
ну есть жизнь на марсе-и это пока не опровергнуть

придется поверить на слово biggrin

 
OzДата: Вторник, 26.01.2010, 22:45 | Сообщение # 8
Полковник
Группа: Пользователи
Сообщений: 250
Награды: 0
Репутация: 2
Статус: Offline
Посмотрите на это с другой точки зрения. Если известно общее количество генов и процент кроссинговера, то подсчитав количество кроссов по окраске или по фоновым или по плавникам и т.д. можно получить примерное количество генов, учавствующих в образовании окраски, фоновых и плавников. good
 
genetika-guppyДата: Вторник, 26.01.2010, 22:52 | Сообщение # 9
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Quote (Oz)
Если известно общее количество генов

не известно оно, только совсем примерно

 
genetika-guppyДата: Вторник, 26.01.2010, 23:14 | Сообщение # 10
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Ну посчитать то можно примерно - взять общее кол-во генов у медаки (правда у нее 24 хромосомы) и разделить на кол-во хромосом у гуппи (23). Но это только совсем примерно получится. cool
 
genetika-guppyДата: Среда, 27.01.2010, 14:29 | Сообщение # 11
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Quote (Владимир)
ТОГДА УЖ ЛУЧШЕ С ЧЕЛОВЕКОМ СРАВНИТЬ-КОЛ-ВО ХРОМОСОМ ОДИНАКОВОЕ

Медака - на сегодняшний день самая близкая из рыб с полностью охарактеризованным геномом. Форма и размер хромосом близки к гуппи, а у человека кол-во генов и размер хромосом сильно отличаются по определению.

Сейчас все ихтиологи сравнивают геном гуппи именно с медакой. wink

 
genetika-guppyДата: Среда, 27.01.2010, 14:52 | Сообщение # 12
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Причина скорее всего в том, медака в отличии от гуппи икромечущая рыба - удобнее изучать эмбриоанальные гены на развивающейся икре - также как и данио, фугу и др. Все они из разных отрядов, но все - икромечущие и всех можно было в итоге между собой сравнивать. У медаки тоже есть разные популяции, которые отличаются фенотипически.
 
genetika-guppyДата: Среда, 27.01.2010, 14:58 | Сообщение # 13
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
По данным этой групы ученых:

http://www.nature.com/nature/journal/v447/n7145/full/nature05846.html

у медаки 20 141 ген, соответсвенно на 24 хромосомы это будет около 840 генов на хромосому.

Умножаем на 23 - получаем около 19 300 генов у гуппи.

Так что предположительно на каждой хромосмое у гуппи находится 800-900 генов (на Y-хромосоме должно быть меньше, так как она короче).

 
genetika-guppyДата: Среда, 27.01.2010, 15:06 | Сообщение # 14
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Это конечно очень приблизительный расчет - все хромосомы отличаются по длинне, есть и 600 генов и 1000.
Я сильно усреднил это кол-во.
 
genetika-guppyДата: Среда, 27.01.2010, 15:37 | Сообщение # 15
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Quote (Владимир)
А ПРО КРОССИНГОВЕР У МЕДАКИ ТАМ ЕСТЬ ИНФА,НУ И КАК ЕГО УСТАНАВЛИВАЛИ

Кроссинговер тут не при чем - он лишь помогает понять расположение и удаление генов друг от друга на хрмосомах. Сейчас используются более точные молекулярно-генетические методы.

 
genetika-guppyДата: Среда, 27.01.2010, 15:45 | Сообщение # 16
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Quote (Владимир)
ТАК ТОГДА КАКАЯ РАЗНИЦА ИКРОМЕЧУЩИЕ ЭТО ИЛИ ЖИВОРОДЯЩИЕ

Чтобы понять его функциональную часть - секвенировать геном просто, но нужно еще понять какие гены за что отвечают. Поэтому развивающаяся икра - очень удобный способ.

 
genetika-guppyДата: Среда, 27.01.2010, 15:51 | Сообщение # 17
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
http://earth.lab.nig.ac.jp/~mbase/ml_base.html

Вот тут есть данные по геному медаки.

 
OzДата: Среда, 27.01.2010, 21:38 | Сообщение # 18
Полковник
Группа: Пользователи
Сообщений: 250
Награды: 0
Репутация: 2
Статус: Offline
Quote (genetika-guppy)
на Y-хромосоме должно быть меньше, так как она короче

Насколько верны эти сведения именно для гуппи? Есть кариотипирование самок и самцов для наглядности?
 
genetika-guppyДата: Среда, 27.01.2010, 22:09 | Сообщение # 19
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Quote (Oz)
Есть кариотипирование самок и самцов для наглядности?

Да есть, я посылал фотку Владимиру Викторовичу - разница очевидна.

Интересно не это, а то, что почти вся Y-хромосома имеет гомологию с X-хромосомой, а значит способен к рекомбинации и только небольшой участок внутри Y-хромосомы не имеет.
Это значит, что большинство генов может "перпыгивать" из одной хромосомы в другую. Причем полоопределяющий участок достаточно небольшой,а второй - намного больше и видимо как раз он не сильно влияет на физиологию самок при кроссинговере, тем нее менее придавая им определнные цветовые узоры на корпусе и плавниках.

 
genetika-guppyДата: Среда, 27.01.2010, 22:14 | Сообщение # 20
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Quote (Владимир)
ПРОСТО ЭТО Я К ТОМУ,ЧТО У ГУППИ ПОЛУЧАЕТСЯ 20000 ГЕНОВ-ПРОЦЕНТ КРОССИНГОВЕРА 40%-ПРИКИНЬ ПО СКОЛЬКИ ПРИЗНАКАМ ДОЛЖНЫ ОТЛИЧАТЬСЯ РЫБЫ

А так и есть и именно поэтому в инбридинге они нормально живут десятилетиями. Разнообразие аллелй дает им возможность приспособиться. Просто доля генов формы и цвета среди них невилика и мы видим только малую часть правды. Хотя судя по природным популяциям - двух одинаково окрашенных самцов не найти.
Кроссинговер и тут старается... wink

 
genetika-guppyДата: Среда, 27.01.2010, 22:34 | Сообщение # 21
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
А самый большой сюрприз - это то, что Y-хромосома больше, чем X-хромосома. поскольку обычно бывает наоборот (фото д-ра Хакана Турессона).

Прикрепления: 5596951.jpg(23.2 Kb)
 
genetika-guppyДата: Среда, 27.01.2010, 23:34 | Сообщение # 22
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Quote (Владимир)
А КАК ЖЕ ФОТО - ЧТО МНЕ ПОСЫЛАЛ

а вот оно и есть...

 
genetika-guppyДата: Среда, 27.01.2010, 23:35 | Сообщение # 23
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Quote (Владимир)
ЗНАЧИТ НУЖНО ЧЕТКО УКАЗЫВАТЬ

я стараюсь, могу еще более четко biggrin

 
OzДата: Четверг, 28.01.2010, 21:57 | Сообщение # 24
Полковник
Группа: Пользователи
Сообщений: 250
Награды: 0
Репутация: 2
Статус: Offline
По фото видно, что У-хромосома в 2 раза больше Х-хромосомы.
 
genetika-guppyДата: Четверг, 28.01.2010, 22:22 | Сообщение # 25
Admin
Группа: Администраторы
Сообщений: 2794
Награды: 1
Репутация: 5
Статус: Offline
Quote (Владимир)
тогда с чего ты взял,что У-хромосома короче

Берутся самец и самка - у них сравниваются все хромосомы - у самца одна пара (половые хромосомы) не идентичные, далее сравниваются с таковыми у самки и таким образом вычисляется Y-хромосома.

Я не утверждаю, что это абсолютная истина но несколько авторов проводили исследования на эту тему и получили такой результат.

 
Форум / Forum » Гуппи (Poecilia reticulata Peters 1859) » Генетика гуппи » Гуппи и кроссинговер
  • Страница 1 из 6
  • 1
  • 2
  • 3
  • 4
  • 5
  • 6
  • »
Поиск:

Copyright MyCorp © 2022 | Используются технологии uCoz